山东农业大学本科专业有93个：遥感科学与技术、计算机科学与技术、道路桥梁与渡河工程、网络工程、资源循环科学与工程、动物医学、水利水电工程、交通运输、木材科学与工程、草业科学、食品质量与安全（中英合作）、机械电子工程。
葡萄与葡萄酒工程、水土保持与荒漠化防治、农学、食品科学与工程、水产养殖学、生物工程、车辆工程、自动化、植物科学与技术、水文与水资源工程、通信工程、空间信息与数字技术、种子科学与工程、食品质量与安全、计算机科学与技术专业（惠普软件开发方向）、动物科学、风景园林、农业资源与环境、土木工程（房屋建筑方向）、园艺、计算机科学与技术专业（惠普软件测试方向）。
土木工程（装饰工程方向）、电气工程及其自动化、物联网工程、林学、设施农业科学与工程、给排水科学与工程、建筑学、烟草、建筑环境与能源应用工程、蚕学、测绘工程、茶学、植物保护、森林保护（有害生物防控方向）、环境工程、农业机械化及其自动化、制药工程（兽药方向）、园林、森林保护（菌物资源与利用方向）、土地资源管理（中英合作）、社会体育指导与管理。
数学与应用数学、音乐学、国际经济与贸易、信息与计算科学、农林经济管理、录音艺术、金融学、财务管理、应用化学、旅游管理、生态学、电子信息科学与技术、经济学、工程管理、环境科学、地理信息科学、国际经济与贸易（中德项目）、工商管理专业（高水平运动员）、英语、市场营销、生物技术、工商管理专业（中德项目）、工商管理、日语、会计学（中德项目）。
动植物检疫（动检方向）、农村区域发展、城市管理、俄语、会计学、法学、生物科学、材料化学、秘书学、行政管理、商务英语、中药资源与开发、环境设计（景观设计）、环境设计（室内设计与建筑设计方向）。
