重庆主城区现在主要的火车客运站有重庆站、重庆北站、重庆西站、沙坪坝站。
重庆站是在渝中区菜园坝，所以重庆人也习惯把这个车站称为菜园坝火车站，这个车站目前除了两对走成渝、川黔的慢车外，还有部分走襄渝、兰渝方向的客车。但是过不了多久，重庆站就要封闭改造并且重建，因为这个车站将改造成一个高铁站，连接成渝高铁和渝湘高铁。这个站有210、503等公交线路可到达，距离该站最近的轨道交通站是1号线、3号线的两路口站。
重庆北站是在渝北区龙头寺，该站现在主要是渝怀、渝利、渝万方向的客车，也有少量兰渝、成遂渝、成渝高铁的列车在该站办客，既有动车组也有普速客车，由于重庆北站南场还在改建中，所以目前该站的客车都是在北广场进站上车。可以乘坐轨道交通4号线、10号线在重庆北站北广场下车。
重庆西站在沙坪坝区上桥张家湾一带，2018年随渝贵铁路建成投用，主要始发渝贵、襄渝、成渝高铁几个方向的列车，也有少量兰渝、成遂渝的列车会在此站办客，这个站也是既有普速客车又有动车组列车。目前该站地铁还未开通，所以公共交通现在只有公交车可到达。不过乐观估计，2021年春节前重庆西站有望通地铁，轨道环线和5号线。
沙坪坝站在沙坪坝三峡广场南边，是在原来的沙坪坝火车站原址重建的综合交通枢纽，该站目前始发终到的列车都是成渝高铁的动车组。现在有轨道交通1号线、环线在沙坪坝站换乘。
