区别如下：
1、正科级 的职务 科长,县局局长, 地级市区级局长 地级市 街道办事处主任 乡党委书记 乡长,公安局的大队长,主任科员. 还有高等院校学院下属的行政机构。享受正职待遇，但不一定是老大，也可能是副职。
2、主任科员属于正科级，但属于非领导职务，所以职位略低于现任科长、乡镇长等实职的正科级领导职务。职务工资上有区别，实职正科级略高于主任科员。级别为正科级，未在领导岗位，享受正科级待遇。
