目前（2009年12月）卫生部已经组织专家制定出呼吸、消化、皮肤等22个专业、112个病种的临床路径，如皮肤科的带状疱疹、皮肌炎，儿科的轮状病毒、支原体肺炎，妇科的子宫肌瘤、宫颈癌等。但临床路径并非一成不变的治疗方案，进入临床路径的患者出现严重并发症时，或需要出院、转院时，应当退出当前临床路径。每家综合试点医院至少选择2个治疗专业的病种，作为试点规范临床治疗路径。其中22个专业包括：呼吸内科、消化内科、神经内科、心血管内科、血液内科、肾病学、内分泌、普通外科、神经外科、骨科、泌尿外科、胸外科、心脏大血管外科、妇科、产科、儿科、小儿外科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、肿瘤科。
