出资方
公办大学的出资方是政府，而民办大学的出资方是企业法人。打个比方，好比公办大学是历史悠久的国有企业，而民办大学是创办不久的民营企业。公办大学创办历史比较长，拥有自身的知名度、美誉度，当然公办大学因为主管部门不同，其类型也是很多的，包括985、 211、普通一本、普通二本。民办大学的创办历史一般不是很长仅有十几年二十年的历史而已，是高校扩招特殊历史背景下的产物。
学费
公办高校因为有政府财政补贴，所以这种学校的学费往往不是特别的高，现如今的公办本科学费都在6000元左右。当然公办高校里面也有一些合作办学的项目，这些专业学费可能会高一些。
民办高校因为都是民间资本出资，学校在学费制定方面可能要比公办高校高很多，民办高校的学费往往都在1万元以上，甚至有的达到了好几万元。
专业设置
公办高校的专业往往多而杂，特别是一些综合性的大学追求学科门类齐全以及学校的综合实力，这样的结果就是公办高校的某些专业比较冷门或者是不容易就业。
公办高校为了追求学生的就业率，往往在专业设置方面选择一些文科类比较容易就业的热门专业。公办高校的办学时间不是很长，而理工科专业往往需要一定的积累才能够办学，所以一般公办高校不会设置理工科专业。
民办本科与专科
如果不考虑花费的话，民办本科是要比专科好一些的，因为在社会认可度、就业、考研等很多方面本科学历都要比专科学历有优势。
